Систематическая коллекция отражает систематику минералов - минеральные виды и разновидности, утвержденные российскими и международными минералогическими комиссиями, которые сгруппированы по одной из систем классификации. В эту коллекцию подобраны образцы, характеризующие разнообразие видов и разновидностей минералов по составу, морфологии, физическим свойствам, ассоциациям с другими минералами.